最初建立锁妖塔，是因为南朝梁武帝信奉佛教，斥蜀山等道教为邪魔外道，召集了无数高僧上蜀山修建锁妖塔。
为了修建锁妖塔，南朝遍及天下金刚白玉石，花费了二十余年才完成。全塔布下了无数结界和符咒，但此举遭到当时蜀山中的修仙道士全力反扑，最终梁武帝人马败退，其修建的锁妖塔也被蜀山仙剑派所接管，改成赫赫有名的锁妖塔。
而后神界为了嘉奖蜀山除妖卫道之功，赐下了化妖水，降下五灵封印，利用五灵珠庞大的五灵之力，彻底封印了锁妖塔，从此塔中诸妖再难逃遁。
然而一直到仙剑三时期，魔界至尊——重楼为了取镇妖剑入锁妖塔，却阴差阳错得到了魔剑。重楼在塔顶拔剑时无意中破坏锁妖塔封印，大量妖魔逃出。这才有了仙剑三的后续剧情。
最后女娲后人紫萱（也就是赵灵儿真正的姥姥）与五灵珠之力配合，牺牲自身重新封印锁妖塔。
此后过了17年，到了仙剑三外传：问情篇的时候，因为好大喜功的仙人殊明将锁妖塔的五灵封印改为了七星盘龙柱封印，并在塔底灌入大量化妖水，永绝了锁妖塔被妖怪破坏的可能。
殊明原本用卑劣手段抢走南宫煌（问情篇主角）打通五灵地脉的功劳，是想以此向神界邀功，从而获取更大的权利。
但没想到在关键时候殊明遭到雷元戈的算计，结果被神界册封为“镇狱明王”永镇锁妖塔。
锁妖塔的格局就这样一直延续到了现在……
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